|
|
|
| 宜昌市耐药结核分枝杆菌MIRU-VNTR分子特征及耐药基因突变分析 |
| 纪律, 刘晓俊, 余云芳, 余枫华, 周攀
|
| 宜昌市疾病预防控制中心卫生检验所,湖北 宜昌 443003 |
|
|
|
|
摘要 目的 了解湖北省宜昌市结核分枝杆菌耐药基因位点突变、分布重复单位及可变数目串联重复序列（MIRU-VNTR）分子特征,为耐药结核病防治提供依据。方法 选取2019年1—6月宜昌市所有结核病定点医院检测的涂阳标本和涂阴培阳标本。采用基因芯片法检测利福平耐药相关ropB基因及异烟肼耐药相关katG和inhA基因,分析位点的突变情况;采用24位点的MIRU-VNTR对耐药菌株进行分型。结果 共收集到结核分枝杆菌367株,总耐药58株,总耐药率为15.80%。单耐利福平10株,耐药率为2.72%;单耐异烟肼25株,耐药率为6.81%;耐多药23株,耐药率为6.27%。33株ropB基因突变中531（C→T）突变类型最多,突变13株,突变率为39.39%;复治患者的ropB基因突变率为28.26%,高于初治患者的6.23%（P<0.05）。28株katG基因突变中315（G→C）突变最多,突变26株,突变率为54.17%;18株inhA-15（C→T）突变,突变率为37.50%;inhA和katG联合突变率为4.17%。复治患者的inhA和katG基因突变率为28.26%,高于初治患者的10.90%（P<0.05）。MIRU-VNTR检测结果呈明显遗传多样性,h值最小的是MIRU02和MIRU24,均为0.017,最大的Mtub21为0.774。基因型呈明显多态性,共有49个基因型,15株菌株形成6个簇,近期传播率为15.52%,成簇率为25.86%。结论 宜昌市结核分枝杆菌总耐药率和耐多药率较低,耐药结核病呈现低流行,复治患者耐药基因突变率和成簇率较高。
|
|
| 关键词 ：
结核分枝杆菌,
耐药基因,
位点突变,
分子分型,
成簇率
|
|
收稿日期: 2020-08-14
修回日期: 2020-11-03
出版日期: 2021-02-10
|
|
|
| 基金资助:湖北省卫生与计划生育委员会联合基金项目（WJ2018H241） |
|
通信作者:
刘晓俊,E-mail：735264774@qq.com
|
| 作者简介: 纪律,硕士,主管技师,主要从事卫生检验工作 |
[1] 郭海萍,尚媛媛,李珊珊,等.全基因组测序在结核病分子流行病学研究中的应用[J].预防医学,2020,32(9):899-903.
[2] 吴联朋,吴双辽.基因芯片检测系统在结核分枝杆菌耐药性检测中的应用价值评估[J].中国卫生检验杂志,2018,28(1):47-49.
[3] SUPPLY P,ALLIX C,LESJEAN S,et al.Proposal for standardization of optimized mycobecterial interspersed repetitive unit variable number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis[J].J Clin Microbiol,2006,44(12):4498-4510.
[4] 张志,李雅楠,高会霞,等.邢台地区275株结核分枝杆菌VNTR基因分型及表型耐药研究[J].临床肺科杂志,2017,22(10):1884-1888.
[5] 罗涛. 中国结核病分子流行病学研究进展[J].寄生虫病与感染性疾病,2019,17(3):133-137.
[6] 袁凤花,张培,刘晓俊,等.2009—2014年宜昌市菌阳肺结核一线抗结核药物耐药性分析[J].公共卫生与预防医学,2016,27(1):40-43.
[7] 余云芳,张谨,余枫华,等.宜昌市2014—2015年新患者结核分枝杆菌基因突变及耐药情况分析[J].公共卫生与预防医学,2017,28(2):52-55.
[8] 高华强,卢巧玲,金法祥,等.绍兴市肺结核患者耐药特征分析[J].预防医学,2020,32(4):384-387.
[9] 张天华,刘卫平,李妍,等.陕西省肺结核耐药性监测分析[J].中国热带医学,2017,17(3):226-230.
[10] 许榕青,李丹,林银霞,等.基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性临床应用评价[J].中国人兽共患病学报,2017,33(1):43-48.
[11] 石洁,郑丹薇,朱岩昆,等.河南省结核分枝杆菌MIRU-VNTR和间隔区寡核苷酸分型分析[J].郑州大学学报(医学版),2019,54(3):425-430.
[12] 蒋超. MTUB21等MIRU位点与结核耐药的相关性研究[D].芜湖:皖南医学院,2016.
[13] 李妍,刘海灿,杨健,等.VNTR在陕西省耐药结核分枝杆菌基因分型中的研究[J].临床肺科杂志,2018,23(8):1498-1501.
[14] 段琼红,陈聪,王坚杰,等.武汉市耐多药结核分枝杆菌的MIRU-VNTR分子特征[J].中华疾病控制杂志,2017,21(1):26-29.
[15] 王伟炳,徐飚,姜庆五.运用RFLP或MIRU作为分子标志对结核病传播模式的研究[J].中国防痨杂志,2007,29(l):256-259. |
|
Viewed |
|
|
|
Full text
|
|
|
|
|
Abstract
|
|
|
|
|
Cited |
|
|
|
|
| |
Shared |
|
|
|
|
| |
Discussed |
|
|
|
|
