江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析

doi:10.19485/j.cnki.issn2096-5087.2019.01.016

预防医学

2019, Vol. 31

Issue (1): 65-67 DOI: 10.19485/j.cnki.issn2096-5087.2019.01.016

疾病控制

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江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析

董梅¹, 姚学君², 马永法¹

1.盐城市盐都区疾病预防控制中心,江苏盐城 224005;
2.盐城市疾病预防控制中心

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摘要目的分析江苏省新型布尼亚病毒（SFTSV）分离株全长S片段基因的特征,为SFTSV监测和防控提供依据。方法通过GenBank获取江苏省上传的SFTSV毒株全长S片段基因序列信息,通过构建系统进化树鉴定基因型,分析各毒株间核苷酸和氨基酸序列的同源性。结果获取江苏省上传的35株SFTSV毒株基因信息,毒株分离年份为2010—2014年,主要为人源毒株,有28株,占80.00%。基因亚型主要为C4和C2,分别有16和14株,分别占45.71%和40.00%。35株SFTSV毒株全长S片段基因核苷酸序列同源性百分比为94.38%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.42%~100.00%;35株毒株与各亚型参考毒株间核苷酸序列同源性百分比为94.11%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.18%~100.00%;人源毒株与宿主动物分离株间核苷酸和氨基酸同源性为94.74%~99.91%和91.42%~99.80%。结论江苏省SFTSV分离株序列间亲缘性较近,其核苷酸和氨基酸高度同源。

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关键词 ：新型布尼亚病毒, 全长S片段基因, 分子流行病学, 同源性

收稿日期: 2018-09-07 修回日期: 2018-10-23 出版日期: 2019-01-03

中图分类号:

R373

通信作者: 董梅,E-mail：530918482@qq.com

作者简介: 董梅,本科,副主任医师,主要从事免疫规划和急性传染病防制工作

引用本文:

董梅, 姚学君, 马永法. 江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析[J]. 预防医学, 2019, 31(1): 65-67.

链接本文:

http://www.zjyfyxzz.com/CN/Y2019/V31/I1/65

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