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预防医学  2019, Vol. 31 Issue (5): 437-440    DOI: 10.19485/j.cnki.issn2096-5087.2019.05.002
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DNA条形码技术鉴定浙江省常见鼠形动物研究
侯娟1, 李天奇1, 丁春喜2, 刘钦梅1, 张蓉1, 黄健2, 王金娜1, 吴瑜燕1, 龚震宇1
1.浙江省疾病预防控制中心,浙江 杭州 310051;
2.嘉善县疾病预防控制中心
Application of DNA barcoding to identification of rodents in Zhejiang Province
HOU Juan*, LI Tian-qi, DING Chun-xi, LIU Qin-mei, ZHANG Rong, HUANG Jian, WANG Jin-na, WU Yu-yan, GONG Zhen-yu
* Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention,Hangzhou,Zhejiang 310051,China
全文: PDF(768 KB)  
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摘要 目的 利用DNA条形码技术鉴定浙江省常见鼠形动物。方法 在浙江省嘉善县、龙游县、云和县和宁海县捕获野外鼠形动物,取鼠耳标本提取DNA,采用通用引物PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因测序。将测序获得序列与GenBank中的序列进行Blast序列同源性比对,采用邻接法构建分子进化树鉴定鼠形动物,并与传统形态学方法鉴定结果进行比较。结果 共扩增出22份COI标本,其中18份标本构建的进化树与传统形态学鉴定结果一致;3份标本的鉴定结果存在差异,臭鼩鼱(Suncus murinus)重新鉴定为大麝鼩(Crocidura lasiura),幼年黄毛鼠(Rattus losea)、幼年黄胸鼠(Rattus tanezumi)重新鉴定为幼年褐家鼠(Rattus rattus);1份形态学鉴定为幼年东方田鼠(Microtus fortis)的标本(编号:NH-1)在GenBank中同源性较低,有待进一步鉴定。结论 DNA条形码技术能有效更正传统形态学鉴定可能造成的错误,两种方法联合可提高鼠型动物鉴定的准确性。
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侯娟
李天奇
丁春喜
刘钦梅
张蓉
黄健
王金娜
吴瑜燕
龚震宇
关键词 鼠形动物DNA条形码线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因分类鉴定    
AbstractObjective To apply DNA barcoding to identifying the rodents in Zhejiang Province. Methods Rodents were captured from Jiashan,Longyou,Yunhe and Ninghai counties in Zhejiang Province. The DNA was extracted from ears of rodent samples,and was amplified and sequenced with mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I(COI)genes. The obtained sequences were compared with the related sequences in GenBank,and neighbour-joining evolutionary tree was constructed. Then the results by DNA barcoding and by morphological identification were compared. Results A total of 22 COI gene samples were amplified. The evolutionary tree constructed by 18 samples was consistent with the morphological identification results and 4 samples were different:Suncus murinus should be Crocidura lasiura,infant rats of Rattus losea and Rattus tanezumi was re-identified as Rattus rattus,infant rats of Microtus fortis(sample number:NH-1)needs further identification. Conclusion DNA barcoding can effectively correct the errors of morphological identification,thus combining the two methods could improve the accuracy of rodent identification.
Key wordsRodents    DNA barcoding    COI gene    Identification
收稿日期: 2018-12-19      出版日期: 2019-05-13
ZTFLH:  R332  
基金资助:浙江省预防医学会课题(2017YF13); 国家科技重大专项课题(2017ZX10303404)
通信作者: 龚震宇,E-mail:zhygong@cdc.zj.cn   
作者简介: 侯娟,硕士,主管医师,主要从事病媒生物监测控制工作
引用本文:   
侯娟, 李天奇, 丁春喜, 刘钦梅, 张蓉, 黄健, 王金娜, 吴瑜燕, 龚震宇. DNA条形码技术鉴定浙江省常见鼠形动物研究[J]. 预防医学, 2019, 31(5): 437-440.
HOU Juan, LI Tian-qi, DING Chun-xi, LIU Qin-mei, ZHANG Rong, HUANG Jian, WANG Jin-na, WU Yu-yan, GONG Zhen-yu. Application of DNA barcoding to identification of rodents in Zhejiang Province. Preventive Medicine, 2019, 31(5): 437-440.
链接本文:  
http://www.zjyfyxzz.com/CN/10.19485/j.cnki.issn2096-5087.2019.05.002      或      http://www.zjyfyxzz.com/CN/Y2019/V31/I5/437
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